生物脫氮的基本原理就是先利用好氧階段，通過硝化細菌和亞硝化細菌的協同作用，將NH3-N通過硝化作用轉化為NO2-和NO3-。然后在缺氧條件下，通過反硝化作用將硝氮轉化為N2，N2隨后溢出水面釋放到大氣，參與自然界N的循環，從而達到降低水中氮含量的目的。

氨氧化細菌（AOB，就是把氨氮變成亞硝酸鹽的細菌）最佳生長溫度為25~30℃，亞硝酸氧化細菌（NOB，就是把亞硝酸鹽變成硝酸鹽的細菌）的最佳生長溫度為25~30℃。硝化菌對溫度較為敏感，溫度不但會降低硝化菌的比增長速率，并且會降低其生物活性。在溫度低于15℃時，硝化速率急劇降低。另一方面，反硝化反應的適宜溫度為20～35℃，低于15℃時，反硝化細菌的繁殖速率、代謝速率和生物活性也都會降低，從而導致脫氮效果下降。當溫度低于5℃時，硝化細菌的生命活動幾乎停止。大量的研究表明，硝化作用會受到溫度的嚴重影響，尤其是溫度沖擊的影響更加明顯。

在測試氨氮分析儀的實驗室中，房間內不應有灰塵或銨鹽化合物，不要用硝酸鹽氮進行分析。氨需要用于硝態氮試驗，氨的揮發性很強。試劑從大氣中吸收氨，測試結果很高，氨氮分析儀試驗中使用的試劑，玻璃器皿等應該是單獨存放以避免污染并影響空位值。

氨氮快速檢測儀實驗過程對水的要求非常高，普通蒸餾水不能滿足實施要求，需要加工兩次才能得到無氨水。根據實際工作經驗，當氨-通過蒸餾制備游離水，餾出物的前部分和餾出物的后部應該丟棄，并且只將餾出物的中間部分儲存在密封的玻璃瓶中，使制備的無氨水空位值生產無氨腳時二次加工費力，不經濟。新型去離子水被復合樹脂交流柱取代，取代無氨水測定氨氮，空位吸光度可達到實施要求。